流腦在全年都可以發生，不過一般數量不多，零零散散的，叫做散發。在2—4月份，患者明顯增多，形成一個高峰，這時期叫流行期，其它月份叫散發期。
流腦的發生有明顯的季節性，主要發生在冬末春初。為什么會出現這個流行期，根據分析其原因是在冬末春初，即2—4月份，氣候變化較大，日夜的氣溫變化相差很大，使人體鼻咽部粘膜的濾過機能降低，即天然屏障作用差了，從而促使腦膜炎雙球菌容易侵入呼吸道并進入血流和腦膜。
冬季天寒，人們在室內生活多，同時又正是春節前后，彼此來往頻繁，公共場所和商店等比平常擁擠，這時—旦有傳染源存在，就容易迅速傳播，因而流腦的發生也就隨著增多。待到4—5月份以后，人們的戶外生活增多，病菌傳播的可能性大大減少，從而發病也隨著減少。
